Bio.motifs.pfm 模块

解析各种位置频率矩阵格式文件。

class Bio.motifs.pfm.Record(iterable=(), /)

基类:list

用于存储位置频率矩阵表中信息的类。

该记录继承自包含各个基序的列表。

__str__()

返回 Record 对象中基序的字符串表示形式。

Bio.motifs.pfm.read(handle, pfm_format)

从各种位置频率矩阵格式文件中读取基序。

返回 PFM 的记录。根据传递的格式调用相应的例程。

Bio.motifs.pfm.write(motifs)

以 Cluster Buster 位置频率矩阵格式返回基序的表示形式。