Biopython 教程与食谱
署名作者:Jeff Chang、Brad Chapman、Iddo Friedberg、Thomas Hamelryck、Michiel de Hoon、Peter Cock、Tiago Antao、Eric Talevich、Bartek Wilczyński。
这是来自 Biopython 1.84 的。
- 简介
- 快速入门 - 你可以用 Biopython 做什么?
- 序列对象
- 序列注释对象
- 序列输入/输出
- 序列比对
- 成对序列比对
- 多序列比对对象
- 使用 pairwise2 进行成对比对
- BLAST(新)
- BLAST(旧)
- BLAST 和其他序列搜索工具
- 访问 NCBI 的 Entrez 数据库
- Swiss-Prot 和 ExPASy
- 进入 3D:PDB 模块
- Bio.PopGen:群体遗传学
- 使用 Bio.Phylo 进行系统发育
- 使用 Bio.motifs 进行序列基序分析
- 聚类分析
- 图形,包括 GenomeDiagram
- KEGG
- Bio.phenotype:分析表型数据
- 食谱 - 用它做一些很酷的事情
- Biopython 测试框架
- 从这里去哪里 - 为 Biopython 做贡献
- 附录:关于 Python 的有用信息
- 参考书目