Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_text 模块

Bio.SearchIO 解析器用于 HMMER 纯文本输出格式。

class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_text.Hmmer3TextParser(handle)

基类：object

HMMER 3.0 文本输出的解析器。

__init__(handle)

初始化类。

__iter__()

遍历查询结果。

class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_text.Hmmer3TextIndexer(*args, **kwargs)

基类：_BaseHmmerTextIndexer

HMMER 纯文本输出的索引器类。

qresult_start = b'Query: '

qresult_end = b'//'

__iter__()

遍历 Hmmer3TextIndexer；生成查询结果的键、偏移量、0。

__abstractmethods__ = frozenset({})