Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_text 模块

Bio.SearchIO 解析器用于 Exonerate 纯文本输出格式。

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_text.ExonerateTextParser(handle)

基类: _BaseExonerateParser

Exonerate 纯文本输出的解析器。

parse_alignment_block(header)

解析比对块，返回查询结果、命中和 HSP。

__abstractmethods__ = frozenset({})

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_text.ExonerateTextIndexer(filename, **kwargs)

基类: _BaseExonerateIndexer

Exonerate 纯文本的索引器类。

get_qresult_id(pos)

从最近的“Query:”行返回查询 ID。

get_raw(offset)

从给定偏移量返回 QueryResult 对象的原始字符串。

__abstractmethods__ = frozenset({})