Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar 模块

Bio.SearchIO 用于 Exonerate cigar 输出格式的解析器。

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar.ExonerateCigarParser(handle)

基类：_BaseExonerateParser

用于 Exonerate cigar 字符串的解析器。

parse_alignment_block(header)

解析 cigar 格式的比对块，返回查询结果、命中和 hsp。

__abstractmethods__ = frozenset({})

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar.ExonerateCigarIndexer(filename, **kwargs)

基类：ExonerateVulgarIndexer

用于 exonerate cigar 行的索引器类。

get_qresult_id(pos)

返回最近的 cigar 行的查询 ID。

__abstractmethods__ = frozenset({})