Bio.SCOP.Dom 模块

处理 SCOP DOMain 文件。

DOM 文件已被正式弃用。有关更多信息，请参阅 SCOP“发布说明”。:http://scop.berkeley.edu/release-notes-1.55.html 旧版本的 DOM 文件可以在“SCOP 的其他地方”找到：http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/

class Bio.SCOP.Dom.Record(line=None)

基类：object

保存一个 SCOP 结构域的信息。

属性

• sid - 条目的 SCOP ID，例如 d1anu1

• residues - 结构域定义作为 Residues 对象

• hierarchy - 一个字符串，指定该结构域在层次结构中的位置。

__init__(line=None)

初始化类。

__str__()

将 SCOP 结构域记录表示为以制表符分隔的字符串。

Bio.SCOP.Dom.parse(handle)

将 DOM 文件作为每行一个 Dom 记录进行迭代。

参数

• handle – 类文件对象。