Bio.Phylo.Newick 模块

与 Newick 树对应的类,也用于 Nexus 树。

参见 Bio.Nexus 中的类:Trees.Tree、Trees.NodeData 和 Nodes.Chain。

class Bio.Phylo.Newick.Tree(root=None, rooted=False, id=None, name=None, weight=1.0)

基类:Tree

Newick 树对象。

__init__(root=None, rooted=False, id=None, name=None, weight=1.0)

初始化 Newick 树对象的参数。

class Bio.Phylo.Newick.Clade(branch_length=None, name=None, clades=None, confidence=None, comment=None)

基类:Clade

Newick Clade (子树) 对象。

__init__(branch_length=None, name=None, clades=None, confidence=None, comment=None)

初始化 Newick Clade 对象的参数。