Bio.PDB.StructureAlignment 模块

根据 FASTA 比对将两个结构的残基相互映射。

class Bio.PDB.StructureAlignment.StructureAlignment(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)

基类:object

根据其序列比对对两个结构进行比对的类。

__init__(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)

初始化。

属性
  • fasta_align - 比对对象

  • m1, m2 - 两个模型

  • si, sj - 比对对象中对应于结构的序列

get_maps()

映射结构之间的残基。

返回两个字典,它们将一个结构中的残基映射到另一个结构中对应的残基。

get_iterator()

创建所有残基对的迭代器。