Bio.PDB.StructureAlignment 模块
根据 FASTA 比对将两个结构的残基相互映射。
- class Bio.PDB.StructureAlignment.StructureAlignment(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)
基类:
object
根据其序列比对对两个结构进行比对的类。
- __init__(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)
初始化。
- 属性
fasta_align - 比对对象
m1, m2 - 两个模型
si, sj - 比对对象中对应于结构的序列
- get_maps()
映射结构之间的残基。
返回两个字典,它们将一个结构中的残基映射到另一个结构中对应的残基。
- get_iterator()
创建所有残基对的迭代器。