Bio.PDB.Structure 模块
结构类,表示一个大分子结构。
- class Bio.PDB.Structure.Structure(id)
基类:
Entity
[None
,Model
]Structure 类包含一个 Model 实例集合。
- __init__(id)
初始化类。
- __repr__()
返回结构标识符。
- get_models()
返回模型。
- get_chains()
从模型中返回链。
- get_residues()
从链中返回残基。
- get_atoms()
从残基中返回原子。
- atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None
从原子 X,Y,Z 坐标创建/更新内部坐标。
内部坐标是键长、键角和二面角。
- 参数::
bool (verbose) – 默认 False 描述运行时问题
- internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None
从内部坐标创建/更新原子坐标。
- 参数::
bool (verbose) – 默认 False 描述运行时问题
- 引发::
Exception – 如果任何链没有 .internal_coord 属性
- __orig_bases__ = (Bio.PDB.Entity.Entity[NoneType, ForwardRef('Model')],)
- __parameters__ = ()