Bio.PDB.PDBMLParser 模块

此模块包含用于 PDBML(PDB XML)文件的解析器。

PDBML 是 PDB 数据的 XML 格式表示。

参见 https://pdbml.wwpdb.org/.

class Bio.PDB.PDBMLParser.PDBMLParser

基类:object

用于 PDBML(PDB XML)文件的解析器。参见 https://pdbml.wwpdb.org/.

此解析器基于 PDB 包中提供的 mmCIF 解析器,因为此解析器返回的结构对象与任何给定 PDB 结构的 mmCIF 解析器返回的结构对象相同。

__init__()

初始化一个 PDBML 解析器。

get_structure(source: int | str | bytes | PathLike | TextIO) Structure

从 XML 源解析并返回 PDB 结构。

参数::

source (Union[int, str, bytes, PathLike, TextIO]) – PDB 结构的 XML 表示

返回值::

PDB 结构

返回类型::

Bio.PDB.Structure.Structure