Bio.SeqUtils.CheckSum 模块

用于计算各种序列校验和的函数。

Bio.SeqUtils.CheckSum.crc32(seq)

返回序列（字符串或 Seq 对象）的 crc32 校验和。

请注意，大小写很重要。

>>> crc32("ACGTACGTACGT")
20049947
>>> crc32("acgtACGTacgt")
1688586483

Bio.SeqUtils.CheckSum.crc64(s)

返回序列（字符串或 Seq 对象）的 crc64 校验和。

请注意，大小写很重要。

>>> crc64("ACGTACGTACGT")
'CRC-C4FBB762C4A87EBD'
>>> crc64("acgtACGTacgt")
'CRC-DA4509DC64A87EBD'

Bio.SeqUtils.CheckSum.gcg(seq)

返回序列（字符串或 Seq 对象）的 GCG 校验和（int）。

给定核苷酸或氨基酸序列（或任何字符串），返回 GCG 校验和（int）。GCG 程序使用的校验和。seq 类型 = str。

基于 BioPerl GCG_checksum。由 Sebastian Bassi 在 John Lenton、Pablo Ziliani 和 Gabriel Genellina 的帮助下改编。

所有序列都转换为大写。

>>> gcg("ACGTACGTACGT")
5688
>>> gcg("acgtACGTacgt")
5688

Bio.SeqUtils.CheckSum.seguid(seq)

返回序列（字符串或 Seq 对象）的 SEGUID（字符串）。

给定核苷酸或氨基酸序列（或任何字符串），返回 SEGUID 字符串（A SEquence Globally Unique IDentifier）。seq 类型 = str。

请注意，大小写不重要。

>>> seguid("ACGTACGTACGT")
'If6HIvcnRSQDVNiAoefAzySc6i4'
>>> seguid("acgtACGTacgt")
'If6HIvcnRSQDVNiAoefAzySc6i4'