Bio.SeqIO.GfaIO 模块

Bio.SeqIO 对图形片段组装格式的支持。

此格式由许多组装器输出,并包括有关不同序列如何组合在一起的链接信息,但是,我们只关心片段(序列)信息。

文档: - 版本 1.x: https://gfa-spec.github.io/GFA-spec/GFA1.html - 版本 2.0: https://gfa-spec.github.io/GFA-spec/GFA2.html

Bio.SeqIO.GfaIO.Gfa1Iterator(source)

GFA 1.x 文件的解析器。

文档: https://gfa-spec.github.io/GFA-spec/GFA1.html

Bio.SeqIO.GfaIO.Gfa2Iterator(source)

GFA 2.0 文件的解析器。

版本 2 的文档: https://gfa-spec.github.io/GFA-spec/GFA2.html