Bio.PDB.mmcifio 模块

写入 mmCIF 文件。

有关语法的详细信息，请参见 https://www.iucr.org/resources/cif/spec/version1.1/cifsyntax。

class Bio.PDB.mmcifio.MMCIFIO

基类：StructureIO

将 Structure 对象或 mmCIF 字典写入 mmCIF 文件。

示例

>>> from Bio.PDB import MMCIFParser
>>> from Bio.PDB.mmcifio import MMCIFIO
>>> parser = MMCIFParser()
>>> structure = parser.get_structure("1a8o", "PDB/1A8O.cif")
>>> io=MMCIFIO()
>>> io.set_structure(structure)
>>> io.save("bio-pdb-mmcifio-out.cif")
>>> import os
>>> os.remove("bio-pdb-mmcifio-out.cif")  # tidy up

__init__()

初始化。

set_dict(dic)

设置要写入的 mmCIF 字典。

save(filepath, select=_select, preserve_atom_numbering=False)

将结构保存到文件。

参数：

• filepath (字符串 或 文件句柄) – 输出文件

• select (对象) – 选择要写入的实体。

通常，select 是 L{Select} 的子类，它应该具有以下方法

• accept_model(model)

• accept_chain(chain)

• accept_residue(residue)

• accept_atom(atom)

如果要写出该实体，这些方法应返回 1，否则返回 0。