Bio.NMR.NOEtools 模块
NOEtools:用于根据分配数据预测 NOE 坐标。
输入和输出都模拟了 nmrview 峰列表。此模块适合直接从输入分配峰列表生成包含预测交叉峰的 nmrview 峰列表。
- Bio.NMR.NOEtools.predictNOE(peaklist, originNuc, detectedNuc, originResNum, toResNum)
根据自峰(对角线)分配预测 i->j NOE 位置。
- 参数:
- peaklistxprtools.Peaklist
要从中推导出预测的峰列表
- originNucstr
源核的名字。
- originResNumint
源残基的索引。
- detectedNucstr
检测到的核的名字。
- toResNumint
检测到的残基的索引。
- 返回值:
- returnLinestr
预测交叉峰的 .xpk 文件条目。
备注
假设初始峰列表是对角线(只有自峰),目前没有进行任何检查来确保此假设成立。在尝试使用 predictNOE 之前,请检查您的峰列表是否有错误和非对角线峰。
示例
使用 predictNOE(peaklist,“N15”,“H1”,10,12),其中 peaklist 是 xpktools.peaklist 类型,将生成一个 .xpk 文件条目,用于一个来自残基 10 的 N15 的交叉峰,最终作为残基 12 的 H1 核上的磁化检测到