Bio.NMR.NOEtools 模块

NOEtools:用于根据分配数据预测 NOE 坐标。

输入和输出都模拟了 nmrview 峰列表。此模块适合直接从输入分配峰列表生成包含预测交叉峰的 nmrview 峰列表。

Bio.NMR.NOEtools.predictNOE(peaklist, originNuc, detectedNuc, originResNum, toResNum)

根据自峰(对角线)分配预测 i->j NOE 位置。

参数:
peaklistxprtools.Peaklist

要从中推导出预测的峰列表

originNucstr

源核的名字。

originResNumint

源残基的索引。

detectedNucstr

检测到的核的名字。

toResNumint

检测到的残基的索引。

返回值:
returnLinestr

预测交叉峰的 .xpk 文件条目。

备注

假设初始峰列表是对角线(只有自峰),目前没有进行任何检查来确保此假设成立。在尝试使用 predictNOE 之前,请检查您的峰列表是否有错误和非对角线峰。

示例

使用 predictNOE(peaklist,“N15”,“H1”,10,12),其中 peaklist 是 xpktools.peaklist 类型,将生成一个 .xpk 文件条目,用于一个来自残基 10 的 N15 的交叉峰,最终作为残基 12 的 H1 核上的磁化检测到