Bio.Graphics.ColorSpiral 模块

生成适用于区分分类数据的 RGB 颜色。

此模块提供一个类，该类实现了一个穿过 HSV 颜色空间的螺旋“路径”，允许沿该路径选择多个点，并将输出以 RGB 颜色空间返回，适用于 ReportLab 和其他图形包。

这种颜色选择方法的灵感来自于 Bang Wong 的观点文章：颜色编码，在 Nature Methods _7_ 573 (https://doi.org/10.1038/nmeth0810-573) 中。

该模块还提供了辅助函数，这些函数返回颜色列表，或颜色字典（如果传递了包含要着色的类别名称的可迭代对象）。

class Bio.Graphics.ColorSpiral.ColorSpiral(a=1, b=0.33, v_init=0.85, v_final=0.5, jitter=0.05)

基类：object

实现一条穿过 HSV 颜色空间的螺旋路径。

此类提供了沿穿过 HSV 颜色空间的对数螺旋路径采样点的函数。

螺旋由 r = a * exp(b * t) 描述，其中 r 是从 HSV 圆柱体的轴到螺旋当前点的距离，t 是螺旋旋转到当前点所经过的角度。a 和 b 是（正实数）参数，控制着螺旋的形状。

a：螺旋的起始方向

b：螺旋绕轴旋转的圈数

我们允许螺旋沿圆柱体（“在 V 空间中”）在 v_init 和 v_final 之间移动，以在路径上产生 V（本质上是亮度）的渐变，其中 v_init、v_final 在 [0,1] 中。

还可以提供亮度“抖动”作为 V 空间中的绝对值，以帮助区分路径上的连续颜色点。

__init__(a=1, b=0.33, v_init=0.85, v_final=0.5, jitter=0.05)

初始化一条穿过 HSV 颜色空间的对数螺旋路径。

参数

a - 螺旋的参数 a，控制初始螺旋方向。a > 0
b - 螺旋的参数 b，控制螺旋绕轴旋转的速度。b > 0
v_init - 螺旋的 V（亮度）的初始值。v_init 在 [0,1] 中
v_final - 螺旋的 V（亮度）的最终值。v_final 在 [0,1] 中
jitter - 要添加到每个选定颜色的 V（亮度）抖动的程度。抖动量将从 [-jitter, jitter] 的均匀随机分布中选择，而 V 将保持在 [0,1] 中。

get_colors(k, offset=0.1)

在螺旋上均匀间隔地生成 k 种不同的 RBG 颜色。

一个生成器，返回在定义的 HSV 空间螺旋中沿 k 个均匀间隔的点返回的 RGB 颜色空间值。

参数

Bio.Graphics.ColorSpiral.get_colors(k, **kwargs)

返回 ColorSpiral 对象选择的 k 种颜色，作为一个生成器。

参数

Bio.Graphics.ColorSpiral.get_color_dict(l, **kwargs)

使用提供的值作为键返回颜色字典。

返回一个字典，以可迭代对象 l 的成员作为键，为每个成员分配一种颜色。

参数