Bio.ExPASy.Prodoc 模块

用于处理 Prosite 的 prosite.doc 文件的代码。

参见 https://www.expasy.org/prosite/

已在以下版本中测试

• Release 15.0, 1998 年 7 月

• Release 16.0, 1999 年 7 月

• Release 20.22, 2007 年 11 月 13 日

• Release 20.43, 2009 年 2 月 10 日

函数

• read 读取包含单个 Prodoc 条目的 Prodoc 文件。

• parse 迭代 Prodoc 文件中的条目。

类

• Record 保存 Prodoc 数据。

• Reference 保存 Prodoc 参考文献的数据。

Bio.ExPASy.Prodoc.read(handle)

从包含单个 Prodoc 记录的文件中读取记录。

Bio.ExPASy.Prodoc.parse(handle)

迭代 Prodoc 文件中的记录。

class Bio.ExPASy.Prodoc.Record

Bases: object

保存 Prodoc 记录的信息。

属性

• accession 记录的登录号。

• prosite_refs Prosite 登录号和名称的元组列表。

• text 自由格式文本。

• references 参考文献对象的列表。

__init__()

初始化类。

class Bio.ExPASy.Prodoc.Reference

Bases: object

保存 Prodoc 文献引用的信息。

属性

• number 参考文献编号。（字符串）

• authors 作者姓名。

• citation 描述文献引用。

__init__()

初始化类。