Bio.ExPASy.Enzyme 模块

解析 ExPASy 上的 Enzyme 中的 enzyme.dat 文件。

参见 https://www.expasy.org/enzyme/

已使用 2009 年 3 月 3 日的版本进行测试。

函数

  • read 读取包含一个 ENZYME 条目的文件

  • parse 读取包含多个 ENZYME 条目的文件

类

  • Record 保存 ENZYME 数据。

Bio.ExPASy.Enzyme.parse(handle)

解析 ENZYME 记录。

此函数用于解析包含多个记录的 ENZYME 文件。

参数

  • handle - 文件句柄。

Bio.ExPASy.Enzyme.read(handle)

读取一个 ENZYME 记录。

此函数用于解析包含正好一个记录的 ENZYME 文件。

参数

  • handle - 文件句柄。

class Bio.ExPASy.Enzyme.Record

基类: dict

将来自 ExPASy ENZYME 记录的信息存储为 Python 字典。

每个记录都包含以下键

  • ID: EC 号码

  • DE: 推荐名称

  • AN: 备选名称（如果有）

  • CA: 催化活性

  • CF: 辅因子（如果有）

  • PR: 指向与该酶对应的任何 Prosite 文档条目的指针

  • DR: 指向与该酶对应的任何 Swiss-Prot 蛋白质序列条目的指针

  • CC: 评论

__init__()

初始化类。

__repr__()

返回 Record 对象的规范字符串表示。

__str__()

返回 Record 对象的可读字符串表示。