Bio.Emboss.PrimerSearch 模块
与 EMBOSS 中的 primersearch 程序交互的代码。
- class Bio.Emboss.PrimerSearch.InputRecord
基类:
object表示 primersearch 程序的输入文件。
这使得添加引物信息并将其写入简单的引物文件格式变得容易。
- __init__()
初始化类。
- __str__()
将 primersearch 输入记录作为字符串进行总结。
- add_primer_set(primer_name, first_primer_seq, second_primer_seq)
向记录添加引物信息。
- class Bio.Emboss.PrimerSearch.OutputRecord
基类:
object表示来自 primersearch 任务的信息。
amplifiers 是一个字典，其中键是引物名称，值是 PrimerSearchAmplifier 对象列表。
- __init__()
初始化类。
- Bio.Emboss.PrimerSearch.read(handle)
将 primersearch 的输出获取到 PrimerSearchOutputRecord 中。