Bio.AlignIO.MsfIO 模块

Bio.AlignIO 对 GCG MSF 格式的支持。

该文件格式由 GCG PileUp 和 LocalPileUp 工具生成，后来的工具如 T-COFFEE 和 MUSCLE 支持它作为可选的输出格式。

原始的 GCG 工具会在每个序列的末尾写入间隙，这些间隙可能是缺失数据，用波浪号 (~) 表示，而内部间隙用句点 (.) 表示。此解析器将两者替换为减号 (-)，以与 Bio.AlignIO 中的其余部分保持一致。

您应该通过 Bio.AlignIO 函数（或者如果您想直接处理带间隙的序列，则通过 Bio.SeqIO 函数）来使用此模块。

class Bio.AlignIO.MsfIO.MsfIterator(handle, seq_count=None)

基类：AlignmentIterator

GCG MSF 对齐迭代器。

__next__()

从句柄解析下一个对齐。