Bio.AlignIO.EmbossIO 模块

Bio.AlignIO 支持 EMBOSS 工具输出的“emboss”比对结果。

您应该通过 Bio.AlignIO 函数(或 Bio.SeqIO 函数,如果您想直接使用带间隙的序列)来使用此模块。

此模块包含用于 EMBOSS pairs/simple 文件格式的解析器,例如来自 alignret、water 和 needle 工具的输出。

class Bio.AlignIO.EmbossIO.EmbossIterator(handle, seq_count=None)

基类: AlignmentIterator

Emboss 比对迭代器。

用于从 EMBOSS 工具中读取(成对的)比对结果,它们称为“pairs”和“simple”格式。

__next__()

从 handle 中解析下一个比对。