Bio.AlignIO.ClustalIO 模块

Bio.AlignIO 支持 CLUSTAL W 和其他工具的“clustal”输出。

您应该通过 Bio.AlignIO 函数(或 Bio.SeqIO 函数,如果您想直接处理间隙序列)使用此模块。

class Bio.AlignIO.ClustalIO.ClustalWriter(handle)

基类:SequentialAlignmentWriter

Clustalw 对齐写入器。

write_alignment(alignment)

使用此函数将(另一个)单个对齐写入到打开的文件中。

class Bio.AlignIO.ClustalIO.ClustalIterator(handle, seq_count=None)

基类:AlignmentIterator

Clustalw 对齐迭代器。

__next__()

从句柄中解析下一个对齐。