Bio.Align.hhr 模块

Bio.Align 对 HHsearch 或 HHblits 在 HH-suite 中生成的 hhr 文件的支持。

预计您将通过 Bio.Align 函数使用此模块。

class Bio.Align.hhr.AlignmentIterator(source)

基类: AlignmentIterator

用于 HHsearch 或 HHblits 生成的 hhr 输出文件的对齐迭代器。

HHsearch 和 HHblits 是 HH-suite 程序的一部分，用于隐马尔可夫模型。hhr 格式的输出文件包含单个查询序列的多个成对比对。

fmt: str | None = 'hhr'

__len__()

返回对齐的数量。

对齐的数量被缓存。如果尚未计算，则迭代器将重绕到开头，并通过迭代对齐来计算对齐的数量。然后将迭代器返回到其在文件中的原始位置。

__abstractmethods__ = frozenset({})