Bio.Align.clustal 模块

Bio.Align 对 CLUSTAL W 和其他工具的“clustal”输出的支持。

您应该通过 Bio.Align 函数(如果您只对序列感兴趣,则使用 Bio.SeqIO 函数)来使用此模块。

class Bio.Align.clustal.AlignmentWriter(target)

基类:AlignmentWriter

Clustalw 对齐写入器。

fmt: str | None = 'Clustal'
write_header(stream, alignments)

使用此方法写入文件头。

format_alignment(alignment)

返回一个包含单个对齐的 Clustal 格式字符串。

__abstractmethods__ = frozenset({})
class Bio.Align.clustal.AlignmentIterator(source)

基类:AlignmentIterator

Clustalw 对齐迭代器。

fmt: str | None = 'Clustal'
__abstractmethods__ = frozenset({})