Bio.SwissProt.KeyWList 模块
解析 SwissProt/UniProt 中 keywlist.txt 文件的代码。
- 请参阅
- 类
Record 存储 keywlist.txt 文件中一个关键词或一个类别的信息。
- 函数
parse 解析 keywlist.txt 文件并返回包含其记录的迭代器。
- class Bio.SwissProt.KeyWList.Record
基类:
dict
存储关键词列表中一个关键词或类别的信息。
该记录将 keywlist.txt 文件中的一个关键词或类别信息存储为 Python 字典。字典中的键是 keywlist.txt 文件中可能出现的行代码。
--------- --------------------------- ---------------------- Line code Content Occurrence in an entry --------- --------------------------- ---------------------- ID Identifier (keyword) Once; starts a keyword entry IC Identifier (category) Once; starts a category entry AC Accession (KW-xxxx) Once DE Definition Once or more SY Synonyms Optional; once or more GO Gene ontology (GO) mapping Optional; once or more HI Hierarchy Optional; once or more WW Relevant WWW site Optional; once or more CA Category Once per keyword entry; absent in category entries
- __init__()
初始化类。
- Bio.SwissProt.KeyWList.parse(handle)
从文件句柄解析关键词列表。
返回一个生成器对象,它生成 Bio.SwissProt.KeyWList.Record() 对象的关键词条目。