Bio.SeqUtils.lcc 模块

局部组成复杂度。

Bio.SeqUtils.lcc.lcc_mult(seq, wsize)

在滑动窗口上计算局部组成复杂度 (LCC) 值。

返回一个浮点数列表，即序列滑动窗口的 LCC 值。

seq - 一个明确的 DNA 序列（字符串或 Seq 对象） wsize - 窗口大小，整数

结果与多次应用 lcc_simp 相同，但此版本针对速度进行了优化。优化通过使用先前窗口的值作为基准来计算下一个窗口来实现。

Bio.SeqUtils.lcc.lcc_simp(seq)

计算序列的局部组成复杂度 (LCC)。

seq - 一个明确的 DNA 序列（字符串或 Seq 对象）

返回整个序列的局部组成复杂度 (LCC) 值（作为浮点数）。

参考：Andrzej K Konopka (2005) 序列复杂度和组成 https://doi.org/10.1038/npg.els.0005260