Bio.SCOP.Residues 模块

来自 PDB 结构的残基集合。

class Bio.SCOP.Residues.Residues(str=None)

基类: object

来自 PDB 结构的残基集合。

此类提供用于处理 SCOP 结构域定义的代码。这些定义以一个或多个链片段简洁地表示。例如,“(1bba A:10-20,B:)” 指示 pdb 结构 1bba 中链 A 的残基 10 到 20(包括)和链 B 的所有残基。pdb ID 和括号是可选的。此外,“-” 指示具有一个未命名链的 pdb 结构的所有残基。

开始和结束残基 ID 由残基序列号和可选的单字母插入代码组成。例如,“12”、“-1”、“1a”、“1000”。

pdbid – 可选的 PDB ID,例如,“1bba”。

fragments – 一系列元组 (chainID, startResID, endResID)

__init__(str=None)

初始化类。

__str__()

将 SCOP 残基记录表示为字符串。