根据我们的 下载页面，我们通常建议使用 Python 的包管理器 pip 安装 Biopython

pip install biopython

但是，这不是唯一的选择，另一个打包系统可能更适合您的系统。

Conda

如果您的 Python 是使用 conda 安装的，例如使用 miniconda 或 anaconda，那么您应该能够从 conda 包中使用 Biopython

conda install -c conda-forge biopython

或

conda update -c conda-forge biopython

我们建议使用 conda-forge 频道中的 Biopython，因为它通常是最新的，并且涵盖 Windows、Mac OS X 和 Linux。默认的 Conda 频道确实包含 Biopython，但通常是过时的。

注意 Conda 可用于 Windows、Mac OS X 和 Linux，并且涵盖的范围远远不止 Python。

Linux 包

尽管我们通常建议使用 pip，但大多数 Linux 系统都会提供 Biopython 包 - 不过它可能有点过时。

Ubuntu 或 Debian

您可以使用 Synaptic GUI 工具（在系统/管理/Synaptic 包管理器下的主菜单中）或在命令行中使用以下命令安装 Biopython 及其依赖项：

sudo apt-get install python-biopython

如果您想要文档和单元测试，

sudo apt-get install python-biopython-doc

如果您想使用 BioSQL，

sudo apt-get install python-biopython-sql

但是，这可能不是最新的版本（请参阅 此处列出的 Ubuntu 和 此处列出的 Debian）。如果您想要最新版本的 Biopython，则需要从源代码安装它。但是，您应该能够使用以下命令自动安装构建依赖项：

sudo apt-get build-dep python-biopython

Archlinux

Biopython 位于 官方 Archlinux 存储库 中，名为 python-biopython（用于 Python 3）或 python2-biopython（用于 Python 2），可以使用 pacman 安装

pacman -S python2-biopython

或者，对于 Python 3

pacman -S python-biopython

Fedora

Biopython 是一个官方的 Fedora 包（从 Fedora 5 开始）。该包名为 python-biopython（用于 Python 2）或 python3-biopython（用于 Python 3），可以使用 yum 以 root 用户身份安装

yum install python-biopython

或

yum install python3-biopython

或者通过一些 GUI 包管理系统（例如 pirut 和 PackageKit，在 F-9 及更高版本中可用）。

Gentoo Linux

Gentoo 的 portage 树包含一个 ebuild（sci-biology/biopython），它从源代码构建。要安装它，以 root 用户身份打开一个终端并运行

emerge -va biopython

此处 是 Biopython 在 Gentoo 中的链接，显示了 Gentoo 的 Portage 树中的最新版本。

其他类 Unix 系统

FreeBSD 和 Ports

在 FreeBSD 中安装 Biopython 最简单的方法是通过 Ports Collection。如果您不熟悉此过程，请查看 此文档。假设您熟悉此方法并且拥有最新的 Ports 树，您只需要以 root 用户身份执行以下命令

cd /usr/ports/biology/py-biopython make install clean

这应该会自动获取并安装 Biopython（以及其必要的依赖项）。